计算化学（学术）

以做耦合簇见长的从头算程序，同时也支持HF、微扰

从头计算量子化学程序。可以从RHF，ROHF，UHF，GVB和MC

使用标准量子力学方法描述电子波函数或密度，计算分子

一般性分子动力学软件，对生物体系略有偏重，优点支持

能够实现比较两段核酸或者蛋白序列之间的同源性的功能

Kuntz研究小组发展的分子对接程序

主要应用于执行配体—蛋白分子对接

大型并行量子化学软件；支持密度泛函（DFT）

用途广泛的软件包，一个高度通用的，进行和分析粗粒度

密度泛函平面波赝势代码，一款用于分子动力学从头计算

进行HF，DFT，MP2计算最快最稳定的代码之一

一款著名的从头算分子动力学软件

一款通用的经典分子动力学软件，能方便地在分布式存储并行计算机上对大分子、聚合

一款赝势实空间软件包，用于含时电磁场下的一、二及三

一款开源的从头计算量子化学软件

一款从头计算软件，在多体微扰论及含时密度泛函理论框

可用于计算从周期性体相晶体到纳米结构多种材料

用于模拟纳米结构的量子输运性质（电导），通过实空间

能最全面、最易于使用、效率最高而且完全开源免费的

用于分子和固体的电子结构计算和分子动力学模拟